在日本经济运行基本层面上，也存在导致日元汇率不变，甚至升值的因素。首先是通货紧缩，通货膨胀率和本币的汇率是紧密相关的，它们之间成反比，日本经济呈通货紧缩特点，国内物价的走低应该导致日元的升值才对；其次，虽然它的经常项目盈余在减少，但它毕竟还有大量的盈余，没有出现赤字；再次，它有充盈的外汇储备，即4千多亿美元，世界排名第一。按理说，这么雄厚的外汇储备量不应该导致货币贬值。
日本的问题在哪儿？
日本经济崛起于20世纪50-60年代，这和当时日本所实行的一系列经济政策密切相关。日本政府在40年代大力扶植本国的大企业，主要措施和手段包括：
人为压低居民消费，增加企业积累；
建立主银行制度，将银行和大型生产企业紧密联系在一起，使大企业可以方便地从银行得到资金支持；
促进大企业之间结成卡特尔，并采用保护主义的经济政策，维护大企业的发展；
削减股东权力，方便政府对企业的控制；
企业融资主要采用银行贷款的方式；
建立类似于“计划经济”的经济调控体系，主要表现在政府财政支出“软约束”和行政干预经济等方面；
实行雇佣终身制；
建立公司工会，鼓励甚至强制工人加班。
这一系列政策建立了一个由上及下，等级森严，军队式的经济结构，非常有利于战争时期和战后的经济重建，但也给日本经济带来一系列后遗症。
第一，将资本和劳动力束缚在老企业当中并强迫银行对垂死的企业提供援助，现在，日本银行的呆帐总额达到10，000亿美元。
第二、建立包含出口部门和面向本土市场的部门的二元经济体制，造成面向本土市场的部门生产成本和产品价格过高（比如房地产），最终导致总体生产成本的提高，使很多企业纷纷将生产部分甚至总部迁到海外，损害了出口部门。
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